当前对于脊椎动物的足迹可以划分到纲一级，对于某些无脊椎动物遗迹也只能划分到门 。对于已经绝灭的动物和软躯动物的遗迹分类也很难准确 。因此当前只能采用遗迹形态特征的人为分类，基本上不考虑它们的系统进化关系 。
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二、遗迹化石的保存分类
遗迹化石的保存分类 。既然遗迹是生物成因的沉积构造，因此有些地质学家希望根据遗迹的保存情况进行分类 。
保存在岩层表面的遗迹称为外生迹，而埋藏在沉积底层内部的称为内生迹，内生迹发育为三度空间的构造称为全浮雕，遗迹保存在岩层上表面时称为上浮雕，保存在岩层底面的称下浮雕等 。这种分类对区别遗迹的野外产生情况非常重要 ， 也是判断沉积环境必不可少的分类，然而却和造迹生物的分类无关 。
三、遗迹化石的行为习性分类
遗迹化石的行为习性分类是当前比较广泛被人们采用的遗迹化石分类 。由于遗迹是生物活动的证据，每种遗迹都反映一定的行为习性 ， 因此根据形态特征可以判断相应的生态习性 。
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