众人决定协力消灭幻影旅团 ， 但过程中小杰、奇犽被绑走 ， 酷拉皮卡则抓住了团长 。 只要触碰他人身体就能夺取记忆的旅团成员「派克」从小杰与奇犽身上 ， 得知了酷拉皮卡的秘密 。 于是酷拉皮卡和团长、派克做了交易 ， 他对团长订下「不能使用念能力、不准与旅团成员说话」的条约 ， 并对派克设下「放了小杰与奇犽、不向旅团成员泄漏酷拉皮卡的秘密」的承诺 ， 一旦违反就会死亡 ， 之后小杰、奇犽、团长皆被释放 。 派克为了将自己知道的酷拉皮卡秘密告诉团员 ， 最后违背誓约 ， 被酷拉皮卡的审判小指链刺穿心脏死亡 。
【贪婪之岛篇】
虽然想赶快获得更多父亲的消息 ， 但贪婪之岛的价钱实在太过昂贵 ， 小杰不得其门而入 。 后来 ， 他想到可寻找购买游戏的富翁 ， 再拜托对方让自己进到游戏中 ， 小杰与奇犽也真的成功进入贪婪之岛 。 在岛上他们遇到了少女「比斯吉」 ， 她其实是教导古云的师傅 ， 有感于两人的才能 ， 便施以特训 ， 以强化小杰、奇犽的念能力 。
另外 ， 为了找到能解除团长念力的除念师 ， 幻影旅团的成员与西索也进入游戏中 。 小杰一行人与西索相遇 ， 并肩作战打倒游戏制作人之一的「磊札」 ， 并抓捕了残害其他玩家的「炸弹魔」主谋 。 小杰一行人收集到了游戏破关需要的指定卡片 ， 回到现实世界 。 小杰认为进入游戏中第一个遇到的人可能就是自己的父亲金 ， 但是见到面后 ， 才发现那个人是在鲸鱼岛救过自己一命的金的徒弟「凯特」 。
【嵌合蚁篇】
见到凯特后的小杰、奇犽 ， 在调查未确认生物时 ， 发现了「嵌合蚁」的存在 。 嵌合蚁是一种新生物 ， 女王蚁只要吃下其他物种 ， 就能生出含有其他物种基因的后代 。 为了在对人类产生祸害前阻止 ， 他们决定前往资讯不通、文明落后的地区「NGL」打探更多嵌合蚁的消息 。 途中不巧与女王蚁的护卫队「比多」相遇 ， 凯特为了让小杰、奇犽逃走 ， 牺牲自己的右手 ， 最后死在比多手上 ， 顺利逃出的小杰、奇犽两人此时还不知道凯特已经死亡 ， 向猎人协会求援 ， 希望可以派出讨伐队 ， 尽快救出凯特 。
猎人协会的讨伐队尚未完成之际 ， 女王蚁生下蚁王后死亡 ， 而王蚁直属后卫「尤匹」、「比多」、「普夫」也成为蚁王的直属后卫 。 蚁王统治了东果陀共和国 ， 并在当地人中挑选可成为战士的人类 ， 为了消磨时间 ， 蚁王学习了不同种类的桌游 ， 并在与优秀的「军仪棋」高手、全盲少女「小麦」对战过程中 ， 蚁王渐渐认定对方为心中最特别的人 。
《猎人》剧情懒人包：动漫画集数对照、角色介绍 ， 酷拉皮卡下船前再复习一次休刊为止的故事！|乐吃购！日本猎人协会派出了「尼特罗」、「莫老五」、「诺布」、「秀托」、「拿酷戮」、「庞姆」等6名讨伐队成员 ， 尼特罗负责和蚁王决斗 ， 其他5人则被分配了不同的任务与对手 。 相信着凯特还活着的小杰 ， 决心与比多决斗 ， 原本希望比多能将已成傀儡的凯特复原 ， 却无法如愿 ， 内心充满着憎恨与绝望的小杰选择使用自己的身体来制定「制约与誓约」 ， 换取强大的力量 ， 一瞬间小杰长成为超级壮硕的成年男性（又被网友戏称为「大杰」 ， 收录在新版动画131话／漫画29集305回） ， 原本短短刺刺的头发也瞬间变成长发一飞冲天 。 小杰打败比多后精疲力尽地倒下 ， 被即时赶来的奇犽带走 。
使用「制约与誓约」后的小杰蚁王拥有强大力量 ， 就连猎人会长「尼特罗」也完全不是他的对手 ， 还被蚁王夺去了右脚与左手 ， 自知没有胜算的尼特罗最后做出的自杀攻击 ， 令蚁王身受重伤而濒死 。 赶赴蚁王身边的普夫、尤匹 ， 即使牺牲自己的细胞也无法救回蚁王 ， 最后因吸入爆炸中的有毒物质而死 。 深知待在蚁王身边唯有一死的小麦 ， 也决定陪着蚁王 ， 两人最后握着手 ， 死于棋盘边 。 凯特的灵魂转世到蚁王的双胞胎妹妹身上 ， 嵌合蚁篇就在此划下句点 。
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