农业现代化的本质就是把农、林、牧、副、渔各业的生产和管理逐步建立在科学的基础上，以相对少的能量和物质，取得最好的经济效益 。稻鱼共生生态系统的应用价值就在于此 。
稻田养鱼可使稻谷增产一成以上 。就田块的土壤肥瘦而论，通过试验证实，鱼对每种稻作类型在不同肥瘦田的作用也是成正相关的关系，即田块肥沃度大，增产幅度也大 。由此看来，在丰产田或优良水稻品种田将更能显示出鱼类促稻增产的优越性 。另外，在草荒大的田块中增产的幅度也特别显著 。鱼类在稻田中生活的时间也是决定稻谷增产幅度的因素 。鱼在晚季稻田中生活的时间最短，故增产幅度最低；早稻田次之；中稻田与一季晚稻田时间最长，增产稻谷的幅度也最高 。稻田养鱼的稻谷增产效果显著，并且还有鱼种收入，这是稻田养鱼的优越之处 。
长期以来，稻田中的杂草全靠人工拔除或用化学除草剂去消灭，严重地耗费了人力物力，而且后者还造成土壤的板结和谷粒与环境的污染 。稻田里养了草鱼夏花以后，可以消灭田中消耗肥料的杂草、浮游生物和落水的害虫，省去了人工除草的繁重劳动，而且有人工除草无法相比的除草经常性，更有化学除草剂不能比拟的彻底性 。没有养鱼的稻田尽管经过两三次的中耕除草，杂草量还是上升得很快，而养鱼稻田的杂草越到中、后期越少 。这是稻鱼共生的突出优点，也是农业上一项较大的技术改进 。到后期，草鱼不但吃掉了稻田中的杂草，还可以吃掉多余的稻脚叶，使稻禾通风透光；鱼吃掉了稻田中的杂草，不仅有利于本茬稻禾的生长，而且因改善了土壤状况，对下一茬作物的生长也有利 。这应是稻作栽培学上一件很有价值的技术革新 。
稻田养了草鱼夏花后，可以把外溢的物质和能量拦截下来，鱼粪又可以肥田，促进稻禾生长 。草鱼粪肥中除含有氮和钾外，还含有丰富的磷肥，是稻禾分蘖孕穗不可缺少的肥料 。据分析，养草鱼稻田的磷含量是未养鱼稻田的2倍 。草鱼的食料主要是杂草、浮游生物和落水害虫，这些生物不仅不能被稻禾直接利用，相反的还是稻禾肥料的掠夺者 。草鱼捕食了它们，使本来要损失的肥料，得到了利用，草鱼还把其中不能消化吸收的部分变成粪肥排泄出来，转变为稻禾能吸收的肥料 。鱼在稻田中来回游动觅食，使泥土翻松通气，有利于肥料的分解，有利于土壤的通透性，从而促进稻禾分蘖和根系发育 。
【稻鱼共生在水稻栽培技术中的应用价值】稻鱼共生作用巧妙地把原有矛盾的水稻栽培和草鱼种饲养有机地结合在一起，把两种不同的生产场所合并在一起，虽有晒田、施化肥、使用农药等本来对鱼不利的情况 。然而，采用了人工措施后，就克服了稻鱼的矛盾 。
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