(二)繁殖无病种子在良种场或种子繁殖基地繁殖无病种子 。种田距离大田至少在100米以外，所用种子，必须经过严格的处理，保证全部无病 。
做好无病种子的繁殖工作是防治此病的根本措施，可以免去种子处理的繁重工作 。
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(三)选育抗病品种小麦散黑穗病菌生理小种变异速度较为缓慢，小麦对散黑穗病抗性是单基因显性遗传，抗原也丰富，有利于抗原品种的选育 。
在选育抗病品种中，可以利用病菌不能进入胚内，或进入胚内但在分生组织发育上有差异，以及闭花授粉避病的特点进行选育工作 。
【小麦散黑穗病的主要防治措施有哪些 小麦散黑穗病的病害发生途径】在选育小麦新品种的过程中，除针对当地流行性强，毁灭性大的病害外，同时也应将抗散黑穗病作为一项选育指标，以供品种决选时参考 。
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