目前对猪囊虫病的免疫预防研究报道很多，免疫抗原有囊尾蚴匀桨抗原、分泌代谢抗原、纯化抗原等，其保护率可达80%?90% 。采取査、驱、检、管等综合措施进行防治 。査清囊虫病患者，彻底驱除人体囊虫 。对屠宰猪认真进行肉品卫生检验，检出有囊虫的猪肉，应进行无害化处理，保证肉食品安全 。管理好猪和人的奠便，切断猪感染囊虫的途径 。
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