发酵床养鸡技术在20世纪50年代首先内日本山岸会进行研究开发 。日本山岸会会长山岸已代藏先生，在养鸡实践中坚持把尊重鸡的基本权利放在首位，创建了山岸养鸡法 。
山岸已代藏先生认为要想在养鸡上获得成功，精神要先行于技术及经营 。目前，日本山岸会已在日本、韩国、泰国、德国、瑞士、澳大利亚、美国、巴西建成50多个山岸农法示范基地 。这些基地遵循循环农业的原理 ， 将养殖业与种植业有机地结合在一起 。
以发酵床养殖为主的土著菌技术就是其中的一项重要技术 。土著菌养殖的对象也从养鸡逐步发展到养猪、养肉牛，并巧妙地利用了畜力来进行发酵床的管理 。
从利用畜力来进行发酵床管理的效果看，鸡要优于猪，猪又优于牛 。猪主要是用鼻子拱；鸡既用嘴啄食，又用脚刨食；牛既不会拱，又不会刨 。在垫料用量方面，养鸡用的垫料比养猪所用少得多，得到垫料容易得多；从发酵床的建造要求看，建养鸡发酵床比建养猪发酵床容易得多 。
韩国从1965年开始学习日本以应用发酵床技术为主的土著菌技术 。经过几十年的实践，对理论进行不断发展和完善，创建了韩国的自然农法 。
韩国自然农业协会会长赵汉圭先生认为：自然农业养鸡，不需要太多的资本和什么特别的技术，它最需要的是在大自然怀抱中的爱心 。只要去体会一次，无需这样或那样的培训和繁多的书本知识，不用掌握很多的技术，无论是什么人，都能获得稳定的收益，与其为了寻找什么捷径而烦恼，不如选择面向未来的自然养鸡这条阳关大迫 。【中国发酵床养殖技术网 国外发酵床养殖技术的发展过程简介】
20世纪40年代，日本微生物专家岛木觉也先生开创研究了酵素菌技术(称岛本微生物农法)，并于1970年建立了第一个发酵床系统 。该系统利用坑道以木屑作垫料 ， 上面加盖塑料薄膜使垫料发酵 。这项技术于20世纪80年代后期进入实用阶段 。
目前，在荷兰等国家，采用深层垫料养殖系统，更主要的原因是减少圈舍内氨气的释放，因此 ， 大量试验比较了不同垫料对氨及其他气体释放的影响 。结果认为，秸秆与草炭或木屑的配合使用，有助于减少氨的释放 ， 但会增加温室气体氧化亚氮的生成和释放 。
近年来 ， 世界上已有近百个国家在生产和使用生物酵素美国、朝鲜、巴西、中国、法国、澳大利亚、韩国、国、印度尼西亚、巴基斯坦和印度等 。
