有机肥与化肥混用的优点取长补短 ， 培肥地力化肥的养分单一 ， 含量高，肥效快，但持续时间短；而有机肥养分齐全，肥效持久，可以改良土壤，培肥地力 。二者混用，可以取长补短，全面供给作物生长所需养分，促进作物健壮生长，提高增产效益 。
保蓄养分，减少流失
化肥溶解快，溶解度大，施入土壤后，土壤溶液浓度一时会很快增高，造成较高的渗透压，影响作物对养分和水分的吸收，增加了养分的流失机会 。有机肥和化肥混合使用 ， 可以克服土壤溶液陡然增高的弊病，同时，有机肥可以改善作物对养分的吸收条件，提高土壤蓄水保肥能力，防止和减少化肥养分的流失，提高化肥利用率 。
减少养分固定 ， 提高肥效化肥施入土壤后，有些养分会被土壤吸收，鳌合或固定，降低肥效 。如过磷酸钙和钙镁磷肥直接施入土壤 ， 容易同土壤中的铁、铝、钙等元素结合，生成难溶性的磷酸物而被固定 ， 造成有效养分损失 。若与有机肥混合施用，不仅可减少与土壤接触面 ， 减少土壤与化肥的固定机会，而且可使磷肥中那些难溶性的磷转化成作物能利用的有效磷 ， 提高磷肥的肥效 。
改善土壤结构，促进持续增产长期单施化肥会破坏土壤的团粒结构，造成土壤黏重板结，降低耕作性能和供肥性能 。有机肥含有丰富的有机质 ， 可活化疏松土壤，降低容量；可改善土壤的水、肥、气、热等理化性状；调节酸碱度 。二者混用，既可提高产量，又可促进农业的可持续性发展 。
促进微生物活动 ， 增加土壤养分有机肥是微生物生活的能源，化肥是微生物生长的无机营养 ， 二者混用促进微生物活动，进而促进有机肥的分解 ， 产生大量二氧化碳和有机酸，有助于土壤中难溶性养分溶解，供给作物吸收 。二氧化碳能增加作物的碳素营养，提高光合效率 。微生物生命短暂，死亡后即分解释放出养分 ， 供作物吸收利用 。
适宜混施的有机肥和化肥厩肥、堆肥与过磷酸钙或钙镁磷肥混施过磷酸钙和钙镁磷肥与厩肥、堆肥、沤肥、混合堆沤后施用，不但减少磷肥与土壤的接触面，避免磷酸根离子被土壤固定，而且有机肥料分解生成的各种有机酸，能促使被土壤固定的磷素释放出来，供作物吸收，肥效可提高三分之一 。
厩肥、堆肥与碳铵和尿素混施在厩肥、堆肥中加入0.5%～1%的碳铵（或酸）和人粪尿 ， 有利于微生物繁殖和活动，促进有机肥的腐熟和各种养分释放，为作物提供丰富的营养元素 。
人粪尿与过磷酸钙或钙镁磷肥混施腐熟的人粪尿中碳酸铵含量过多，单施容易挥发损失，与过磷酸钙或钙镁磷肥混施，经过化学反应可形成性质稳定的磷酸二氢铵，既减少了人粪尿素中氮素损失，又增加了磷素营养 。以磷保氮，肥效大增 。
人粪尿与硫酸亚铁混施在人粪尿中加入0.5%的硫酸亚铁 ， 可使人粪尿中极易挥发的碳酸铵转化成性质稳定的硫酸铵，起到保肥除臭 ， 防止氮素挥发流失的作用 。
不宜混施的有机肥与化肥未腐熟的农家肥不能与硝态氮肥混施若混施，农家肥中的反硝化细菌会使硝态氮肥发生反硝化作用 ， 生成亚硝酸盐，引起氮素损失，降低作物品质 。
草木灰不能与氮素化肥混施草木灰是碱性肥料 ， 若与氨态氮、硝态氮等酸性氮素化肥混施，则会发生中和分解反应 ， 释放出氨气挥发，造成氮素损失，降低肥效 。
草木灰不能与过磷酸钙混施草木灰含钙较多，若与过磷酸钙混合 ， 会生成不溶性的磷酸钙，使磷素被固定，作物不能直接吸收利用 。
草木灰不能与厩肥、堆肥、人粪尿混施草木灰一般被当作钾肥施用 ， 呈碱性，若与厩肥、堆肥、人粪尿混合，会加速氮素以氨气形式挥发损失 。
结语【有机肥与化肥混用的科学依据】综上所述，有机肥与化肥混用不仅可以发挥各自的优势，弥补彼此的不足 ， 还可以通过改善土壤结构、提高养分利用率等方式来增强农田生态系统的整体生产力 。这也是当前及未来施肥的方向和趋势 。
