个税汇算清缴不超过12万但缴税了可以根据计算公式计算是否符合退税条件，如果符合的话可以申请退税 。
具体计算公式如下：
应退或应补税额=[(综合所得收入额-60000元-“三险一金”等专项扣除-子女教育等专项附加扣除-依法确定的其他扣除-符合条件的公益慈善事业捐赠)×适用税率-速算扣除数]-已预缴税额
已预缴税额大于年度汇算应纳税额且申请退税的；
依法申请退税是纳税人的权利 。只要纳税人预缴税额大于纳税年度应纳税额 ， 就可以依法申请年度汇算退税 。实践中有一些比较典型的情形，将产生或者可能产生退税，主要如下：
1.纳税年度综合所得年收入额不足6万元，但平时预缴过个人所得税的；
2.纳税年度有符合享受条件的专项附加扣除，但预缴税款时没有申报扣除的；
3.因年中就业、退职或者部分月份没有收入等原因，减除费用6万元、“三险一金”等专项扣除、子女教育等专项附加扣除、企业（职业）年金以及商业健康保险、税收递延型养老保险等扣除不充分的；【黑龙江个税汇算清缴不超过12万但缴税了能办理退税吗？】
4.没有任职受雇单位 ， 仅取得劳务报酬、稿酬、特许权使用费所得，需要通过年度汇算办理各种税前扣除的；
5.纳税人取得劳务报酬、稿酬、特许权使用费所得，年度中间适用的预扣预缴率高于全年综合所得年适用税率的；
6.预缴税款时 ， 未申报享受或者未足额享受综合所得税收优惠的 ， 如残疾人减征个人所得税优惠等；
7.有符合条件的公益慈善事业捐赠支出，但预缴税款时未办理扣除的，等等 。
扩展阅读：
