累计84位论文作者，科学家解开人类细胞真实面貌的秘密 _论文

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大约 7 年前，美国艾伦细胞科学研究所（Allen Institute for Cell Science）刚成立不久。那时，该研究所试图找出用荧光蛋白标记细胞内结构的最佳方法，以便既能“看到”它们，同时又尽可能地维持细胞的正常状态。
通过上述努力，该团队创建了人类诱导多能干细胞系的“艾伦细胞集”（Allen Cell Collection）。在这之后，他们尝试对这些活细胞进行三维成像，以便能以足够高的分辨率看清楚细胞的结构。这样一来，就能在不杀死细胞的情况下，对所有细胞进行分析。
不过，还得先完成一个非常艰巨的任务，就是开发图像分析工具，将原始三维图像转换成单个细胞及其内部结构的图像。
完成上述任务之后，一个数据集也随之诞生。这让研究人员可以开发通用的分析框架。该框架基于两个坐标系统：一个用于细胞形状，一个用于细胞内部结构的映射。

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（来源： Nature ）

最近，该团队在 Nature 发表了一篇题为《整合细胞内组织及其在人 iPS 细胞中的变异》（）的论文，共有 84 位作者。
图 | 相关论文（来源：Nature）
曾就职于艾伦细胞研究所（目前在德国莱布尼茨分析科学研究所担任研究组组长）的陈建旭，也参与了这项研究。
在他的引荐之下，艾伦细胞研究所科研副主任苏珊娜·拉菲尔斯基（Susanne Rafelski）告诉 DeepTech：“论文包含了该研究所各个分支团队的几乎所有专业力量，是真正的共同努力的结果。专家们的领域涵盖分子生物学、细胞生物学、计算科学、软件工程、工具可视化等。”

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图 | Susanne Rafelski （来源：资料图）

研究中，课题组揭示了正常细胞用于组织自身的基本规则，借此可以了解一个细胞到底是什么样子，它的内部组件是如何布局的，以及如何从根本上与细胞的行为方式联系在一起。
当然，不同细胞之间也会存在一些“正常”的差异。那么，如何判断在一个细胞中看到的差异，到底是正常变化的一部分、还是疾病的预警？可以说，此次论文的面世，让研究人员拥有了一种可以严格、定量地确定细胞差异的方法。
以这种方法所获的数据为参考，就能对健康和疾病的细胞基?。颖局噬喜羁痰牧私?。当我们知道一个“正常”细胞群所有可能的存在方式时，就可以更准确地确定当细胞群出现异常时，到底问题出现在哪里，从而开发更有效的疾病治疗方法。
此次工作的出色之处在于，研究人员用来分析和可视化特定细胞的方法，也可以用于身体中的许多其他细胞，就像一本指南一样。
例如，研究人员已将这个指南中的一些概念，用于分析其他细胞类型和状态下的细胞组织，除了研究细胞内部的结构之外，他们还在寻找构成这些结构的蛋白质在位置组成上的模式。
Susanne Rafelski 说：“当我第一次看到将细胞结构的平均位置，被绘制成干细胞的平均形状的方法时，这与我多年来仔细观察的数千张干细胞个体图像完美匹配到一起。并准确地总结出所有结果的意义时，我知道这种计算方法在生物学上是有效的，因此，我们现在可以应用它来提出基本的生物学问题。”