药用部分胡黄连 ， 善除湿热，故主久痢成疳及冷热泄痢，厚肠胃 。伤寒咳嗽者 ， 邪热在手太阴、足阳明也 。温疟骨蒸者 ， 热在骨间也 。理腰肾、去阴汗者，肾虚湿热下流客之，使热伏肾间也 。小儿惊痫、寒热、不下食者，热则生风 ， 故发惊痫 ， 热在胃口，故不下食也 。心主五色，脾胃主肌肉，二经湿热去，则颜色自佳也 。
本品与知母、青蒿、地骨皮、银柴胡、秦艽、鳖甲等配伍，可治阴虚发热 ， 午后潮热;与黄连、芦荟等同用 ， 可治小儿疳热等症 。
本品性寒，入心肝二经血分，有退虚热，除骨蒸 ， 凉血清热之功 。治阴虚劳热骨蒸 ， 常与银柴胡、地骨皮等同用 ， 如清骨散(《证治准绳》) 。
本品既能除小儿疳热，又能清退虚热，故可用于小儿疳积发热 ， 消化不良，腹胀体瘦，低热不退等症，常与党参、白术、山楂等同用 ， 如肥儿丸 。
【胡黄连的食用方法】胡黄连与黄连，名称相似且均为苦寒清热燥湿之品，善除胃肠湿热，同为治湿热泻痢之良药 。然胡黄连善退虚热、除疳热;而黄连则善清心火、泻胃火，为解毒要药 。
