1)甜菜生产和甜菜糖加工业是计划管理较弱的产业，行政、行业管理无序，宏观规划和微观计划难切实际，甜菜种植者和甜菜糖生产企业均在短期趋利市场理念左右下进行被动的投机性生产，尚未走入可持续发展的良性循环轨道；
2)转制后的我省甜菜糖加工企业与行政机关、金融机构和甜菜种植者之间的关系发生变化，甜菜和甜菜糖生产全部进入市场，成为脆弱、波动和高风险产业 。行政和金融机构的支持决定着我省甜菜糖业的生存和发展，国内外食糖市场的数量盈亏和价格起伏决定着我省甜菜行业的进退，自然和技术的变数难以预测和控制，特别是我省轻工行政机关的撤消，糖业集团名存实亡，制糖企业各自为政，难以形成规模，抵御大市场冲击的能力脆弱.
【黑龙江省甜菜生产中存在的问题 黑龙江省甜菜生产中存在的问题及对策】
3)我省农村经济相对落后，农业生产力水平低下，旱作型甜菜生产靠天吃饭，抵御自然灾害的能力较弱，甜菜生产技术和单产的整体水平较低，育苗移栽、机械精点和地膜覆盖等集约化栽培技术覆盖率低，低投入、粗放管理的传统种植方式仍为主导；
4)我省甜菜商业用种类型匮乏，种子精加工处理技术滞后，甜菜精加工种子的生产覆盖率低，生产上使用的绝大多数种子仍是未加工的粗种子，纯度和质量难以保证，种子的高新技术附加难以实现，使种子的生产贡献率降低；
5)甜菜种子市场管理无序，技术监督形同虚设，伪假甜菜种子和未经我省品种审定的国内外甜菜种子肆意流通，知识产权和名优产品商标屡遭侵害，致使优良甜菜品种难以在生产上推广应用 。
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