不可直接使用，须经发酵后使用 。人粪尿及动物的粪便必须经过堆肥发酵，才能用于农业种植 。粪便和尿液本身不能变成可吸收的氮、磷和钾，必须进行发酵 。俗话说“生肥”，植物如果用得太多，可能会“烧死” 。科学的解释是，植物在发酵过程中会产生大量的热量，如果不发酵，触碰“肥料”，植物的根系就会受到腐蚀和灼烧 。农村常见的“坑肥”和“堆肥”就是这种原理，在发酵后使用 。
人粪尿必须经过贮存、腐熟后才适宜施用，因为其中含的养分多是有机态的，作物难以吸收 。另外，新鲜人粪含多种寄生虫卵和病菌，经过贮存发酵，既可以使养分转化成速效性的供作物吸收，又可以在腐熟过程中，杀死虫卵和病菌 。合理贮存能加速养分转化，同时也减少肥分损失 。
贮存方式：
（1）密闭沤制 。因为人粪尿在贮存过程中会产生较多的碳酸铵，容易挥发损失，密闭沤制可以减少肥分损失 。在密闭嫌气条件下，经过半个月到1个月，大部分虫卵、病菌将被杀死 。常用的密闭沤制方式有加盖密闭的粪缸，密封的化粪池，以及沼气发酵池等 。
【尿能当肥料浇菜吗 肥料尿素可以浇菜吗】（2）堆制腐熟 。在北方农村，普遍利用人粪尿制作堆肥，如将人粪尿和碎土按一定比例，分层堆积成大粪土；或按一定比例加入作物秸秆、土和家畜粪尿制作高温堆肥 。在堆制过程中用泥浆封堆，既可以防止水分、养分溢出，又可保持一定高温，杀死虫卵和病菌 。
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