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发病原因不同痢疾是由于感染痢疾杆菌或者相应的致病菌后引起的肠道感染症状；肠炎是由于自身免疫力差或者感染、遗传等原因导致的腹泻、便面为表现的消化系统疾病 。
症状不同从表面上两者似乎有着相同的症状 ， 但仔细分析可以知道：痢疾主要是以腹痛、腹泻、里急后重、粘液脓血便为主要表现；结肠炎则是多数隐匿发病，病程较长，主要表现为腹泻或者便秘，也可能出现除消化系统之外的表现，如关节炎，虹膜睫状体炎等表现 。
【痢疾与肠炎的区别】治疗和预后不同治疗上痢疾发病比较急，治疗周期短；结肠炎的发病较缓慢 ， 也有急性发作期 ， 治疗周期比较长 。
并发症不同不同的疾病都会引起相应的并发症，痢疾的发生与肠炎都会出现不同的并发症：
肠炎的并发症主要表现为：，脱水、酸中毒及电解质紊乱 ， 甚至出现低血压与周围循环衰竭 ， 老年人可诱发心肌梗塞甚至还有多种严重疾病 。
肠炎的并发症主要表现为：肠息肉、结肠癌、肠狭窄、肛窦炎、肛管炎、便血等 。
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