区别：组织分离制种属于无性繁殖，而孢子分离制种属于有性繁殖 。组织分离：将种菇清洗干净，然后用镊子夹住放置在培养皿内，使用75%酒精棉球进行消毒，接着使用无菌水清洗3次；清洗后，使用解剖刀在菌盖与菌柄的交界处，切取0.3-0.5cm的菌肉组织块，转移至斜面培养基 ， 置于24℃的恒温箱中进行培养 。
一、食用菌组织分离与孢子分离制种有何区别
1、区别
食用菌组织分离制种属于无性繁殖，而孢子分离制种属于有性繁殖 。
【食用菌组织分离与孢子分离制种有何区别，食用菌组织分离法的优缺点】2、组织分离
（1）选择肉厚肥大，鲜嫩，出菇早，菌柄较短的食用菌作为种菇 。
（2）将种菇清洗干净，然后放在接种箱内进行消毒 。具体操作：用镊子夹住种菇放至于培养皿内 ， 然后使用另一把镊子夹住75%酒精棉球或者是0.1%升汞棉球，进行消毒，接着转移至另一培养皿内用无菌水清洗3次 。
（3）使用解剖刀蘸取适量酒精 ， 进行火焰消毒，待刀冷却后将种菇切开，在菌盖与菌柄的交界处，切取0.3-0.5cm的菌肉组织块 ， 转移至斜面培养基上 ， 置于24℃的恒温箱中进行培养 。
（4）检查生长情况 ， 如果分离出来的菌肉组织块上长出了正常的白色菌丝，说明分离成功 。
3、孢子分离（多孢分离）
（1）选择朵形圆正，长势较好，没有病虫害，出菇均匀，8-9分熟的种菇 。
（2）切掉种菇的大部分，使用无菌水冲洗菌柄处，然后使用脱脂棉将表面水分擦干 。
（3）使用铁丝将种菇的菌褶朝下 ， 挂在玻璃漏斗下面 。漏斗倒盖在培养皿上 ， 上端部分使用棉花将小孔堵住 。
（4）将培养皿放在搪瓷盘上（盘内铺设纱布），静置12-20小时后，孢子散落在培养皿上，形成孢子印 。
（5）使用接种针沾取孢子在试管中的琼脂上进行接种 。等到孢子萌发，生成菌落时，选择萌发时间早，长势好的菌落进行培养 。
二、食用菌组织分离法的优缺点
1、优点
（1）食用菌组织分离相较于孢子分离操作更为简单，成功率更高，后代不容易产生变异 ， 能够较好的保持菌种的优良性质，防止菌种品性退化 。
（2）组织分离法的适应性较广，能够用于绝大多数食用菌制种 。
2、缺点
（1）在多次重复操作过后 ， 容易发生退化 。
（2）组织分离制种很难制出比母体更加优秀的品种 。
（3）在大规模应用与生产之前，需要做品种对比试验，在确定菌种的优良特性没有变异后，才能进行繁殖 。
