1、寄生：草苁蓉寄生在凯木属物根上 ， 肉苁蓉寄生在沙漠树梭梭根上 。2、分布：草苁蓉分布在朝鲜、日本和中国的陕西等地 ， 肉苁蓉主要生产于新疆等 。3、外形：草苁蓉株整体接近无毛 ， 肉苁蓉高大 。4、花色：草苁蓉暗紫色或暗紫色 ， 肉苁蓉淡黄白或淡紫色 。5、环境：草苁蓉喜阴暗潮湿地 ， 肉苁蓉喜轻度盐渍化地 。
一、寄生不同
1、草苁蓉经常寄生在凯木属物根上 。
2、肉苁蓉是沙漠树梭梭根寄生的寄生植物 ， 从梭梭寄生主中吸收养分和水分 。素有沙漠人参的美称 ， 具有极高的药用价值 ， 是中国传统珍贵的中药材 。
二、分布不同
1、草苁蓉分布在朝鲜、日本、俄罗斯（西伯利亚）和中国的陕西（陕北）、黑龙江、吉林和内蒙古 。生长在海拔1500-1800米的山坡、林下低湿度和河边 。
2、肉苁蓉主要生产于新疆、内蒙古阿拉善盟 ， 甘肃、宁夏也分布 。
三、外形不同
【肉苁蓉与草苁蓉的明显区别在哪? 草苁蓉与肉苁蓉有什么不同】1、草苁蓉株高15-35厘米 ， 整体接近无毛 。根茎横行 ， 圆柱状 ， 通常有2~3根直立茎 。
2、肉苁蓉是一种高大的草本 ， 高40-160厘米 ， 大部分地下生 。茎不分枝或自基部分为2~4根 ， 下部直径为5-10（-15）厘米 ， 向上逐渐变细 ， 直径为2~5厘米 。
四、花色不同
1、草苁蓉花冠宽钟状 ， 暗紫色或暗紫色 ， 筒膨大成囊状 ， 上唇直立 ， 接近头盔状 ， 长5~7毫米 ， 边缘短 ， 下唇极短 ， 3裂 ， 裂纹三角形或三角形披针形 ， 长2~2.5毫米 ， 往往向外折叠 。
2、肉苁蓉的颜色有变异 ， 淡黄白或淡紫色 ， 干后经常变成棕色 。
五、环境不同
1、草苁蓉喜欢阴暗、潮湿、低温的环境条件 ， 没有这样的环境条件是没有草苁蓉分布的 。
2、肉苁蓉喜生于轻度盐渍化的松软沙地 ， 一般生长在沙地或半固定沙丘、干枯老河床、湖盆低地等 ， 生境条件差 。适合生长区的气候干旱 ， 降雨量少 ， 蒸发量大 ， 日照时间长 ， 昼夜温差大 。土壤以灰色沙漠土、沙漠土为主 。
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